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更新時間:2025-12-18
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一、MLPA核心原理一句話概括
MLPA通過設計一對特殊的、靶向相鄰DNA序列的探針,只有當這對探針同時與靶序列wanmei結合時,才能連接成一個完整的模板,隨后被通用引物擴增并定量。擴增產(chǎn)物的量直接反映了靶序列的拷貝數(shù)。
二、 MLPA檢測原理分步詳解
下面,我們來詳細解讀流程中的每一個關鍵步驟:
第1步:探針雜交
一對探針:針對每一個待檢測的靶位點,都設計有兩條非常短的寡核苷酸探針。
左探針:包含一段靶序列特異性雜交序列 + 一段通用的“引物結合"序列X。
右探針:包含一段靶序列特異性雜交序列 + 一段長度不等的“填充序列" + 一段通用的“引物結合"序列Y。
特異性結合:將這一對探針與變性后的樣本DNA混合。它們會尋找并精確地雜交到目標DNA上相鄰的位置(通常只間隔1個核苷酸)。
第2步:連接反應(最關鍵的一步)
“連接依賴"的核心:只有當左、右探針都wanmei地與靶DNA結合并緊密相鄰時,連接酶才能將它們共價連接成一條完整的、長的DNA模板。
嚴苛的質(zhì)控:如果靶序列缺失(拷貝數(shù)為0)或發(fā)生點突變導致探針無法結合,連接反應就不會發(fā)生。這確保了后續(xù)信號的特異性,避免了假陽性。
第3步:PCR擴增
通用引物擴增:使用一對針對所有連接產(chǎn)物上通用序列X和Y的引物進行PCR擴增。
產(chǎn)物長度各異:由于每個右探針的“填充序列"長度不同,因此每個靶位點對應的最終PCR產(chǎn)物都具有獨特的長度(就像不同大小的“條形碼")。
第4步:毛細管電泳分離與定量
按長度分離:將所有PCR產(chǎn)物進行毛細管電泳,嚴格按照片段長度進行分離。
熒光檢測:PCR引物或探針上標記有熒光基團,因此每個長度的片段會產(chǎn)生一個熒光信號峰。
第5步:數(shù)據(jù)分析
峰高/面積 = 相對拷貝數(shù):通過軟件分析每個峰的高度或面積。將其與同一反應中多個內(nèi)參基因(已知為二倍體,拷貝數(shù)穩(wěn)定)的峰進行比較。
結果解讀:
正??截悢?shù)(2份):靶位點峰高與內(nèi)參峰高比值約為1.0。
缺失(1份或0份):比值約為0.5或0。
重復/擴增(3份或以上):比值約為1.5或更高。
三、 MLPA原理的獨特優(yōu)勢
1. 高通量:單次反應可輕松檢測40-50個不同的靶位點。
2. 高特異性與準確性:依賴“雙探針wanmei結合"的連接步驟,如同雙重校驗,極大減少了非特異性擴增。
3. 對DNA質(zhì)量要求低:因為探針很短(~50-70 nt),即使DNA部分降解(如FFPE樣本),也能有效雜交和連接,而長片段PCR則會失敗。
4. 可檢測甲基化(MS-MLPA):通過對右探針的雜交序列進行HhaI酶切位點設計。如果靶序列被甲基化,酶切被阻止,探針可連接擴增;如果未甲基化,酶切斷開探針,無法擴增。通過比較酶切處理與未處理的信號,即可判斷甲基化狀態(tài)。
四、與其他技術的核心區(qū)別
特性 | MLPA | 定量PCR | 微陣列比較基因組雜交 |
原理基礎 | 連接依賴的探針擴增 | 引物延伸擴增 | 芯片上的競爭性雜交 |
通量 | 中等(多重) | 低(通常單重或少量多重) | 高(全基因組) |
檢測目標 | 已知靶點的CNV/甲基化 | 已知單靶點CNV/表達 | 未知/全基因組CNV |
DNA需求/質(zhì)量 | 低,耐受降解 | 很低 | 高,需要高質(zhì)量DNA |
總結來說,MLPA的原理精髓在于其“連接依賴"和“長度編碼"的設計,使其成為檢測已知基因拷貝數(shù)變異和甲基化的一種高度多重、精準且經(jīng)濟高效的技術,特別適用于臨床診斷和大規(guī)模篩查。
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荷蘭MRC部分產(chǎn)品目錄:
產(chǎn)品品類 | 產(chǎn)品名稱 | 貨號 |
MLPA探針 | SALSA MLPA探針P333 EP300 | P333 |
SALSA MLPA探針P334 Gonadal | P334 | |
SALSA MLPA探針P335 ALL-IKZF1 | P335 | |
SALSA MLPA探針P343 Autism-1 | P343 | |
MLPA試劑 | SALSA MLPA試劑盒- 100 reactions (6 vials) - Cy5 | EK1-CY5 |
SALSA MLPA試劑盒 - 100 reactions (6 vials) - FAM | EK1-FAM | |
SALSA MLPA試劑盒 - 500 reactions - Cy5 | EK5-CY5 | |
SALSA MLPA試劑盒 - 500 reactions - FAM | EK5-FAM | |
SALSA MLPA試劑盒 - 2000 reactions - FAM | EK20-FAM | |
DigitalMLPA探針 | SALSA digitalMLPA Probemix D001 Hereditary Cancer Panel 1 | D001 |
SALSA digitalMLPA Probemix D006 Multiple Myeloma | D006 | |
SALSA digitalMLPA Probemix D007 Acute Lymphoblastic Leukemia | D007 | |
DigitalMLPA試劑 | SALSA digitalMLPA Reagent Kit | DRK01 |
SALSA digitalMLPA Barcode Plate | BP01 | |
SALSA Ligase Buffer A - 360 µl | SMR12 | |
SALSA Ligase-65 - 115 µl | SMR20 | |
SALSA PCR Primer Mix P5P7 - 240 µl | SMR25 | |
SALSA MLPA Buffer - 180 µl | SMR33 | |
SALSA Ligase Buffer C - 360 µl | SMR37 | |
SALSA Polymerase - 115 µl | SMR55 |
