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MLPA檢測原理

更新時間:2025-12-18點擊次數(shù):15

一、MLPA核心原理一句話概括

MLPA通過設計一對特殊的、靶向相鄰DNA序列的探針,只有當這對探針同時與靶序列wanmei結合時,才能連接成一個完整的模板,隨后被通用引物擴增并定量。擴增產(chǎn)物的量直接反映了靶序列的拷貝數(shù)。

二、 MLPA檢測原理分步詳解

image.png 

下面,我們來詳細解讀流程中的每一個關鍵步驟:

 1步:探針雜交

   一對探針:針對每一個待檢測的靶位點,都設計有兩條非常短的寡核苷酸探針。

       左探針:包含一段靶序列特異性雜交序列 + 一段通用的引物結合"序列X。

       右探針:包含一段靶序列特異性雜交序列 + 一段長度不等的填充序列" + 一段通用的引物結合"序列Y。

   特異性結合:將這一對探針與變性后的樣本DNA混合。它們會尋找并精確地雜交到目標DNA上相鄰的位置(通常只間隔1個核苷酸)。

 2步:連接反應(最關鍵的一步)

   連接依賴"的核心:只有當左、右探針都wanmei地與靶DNA結合并緊密相鄰時,連接酶才能將它們共價連接成一條完整的、長的DNA模板。

   嚴苛的質(zhì)控:如果靶序列缺失(拷貝數(shù)為0)或發(fā)生點突變導致探針無法結合,連接反應就不會發(fā)生。這確保了后續(xù)信號的特異性,避免了假陽性。

 3步:PCR擴增

   通用引物擴增:使用一對針對所有連接產(chǎn)物上通用序列XY的引物進行PCR擴增。

   產(chǎn)物長度各異:由于每個右探針的填充序列"長度不同,因此每個靶位點對應的最終PCR產(chǎn)物都具有獨特的長度(就像不同大小的條形碼")。

 4步:毛細管電泳分離與定量

   按長度分離:將所有PCR產(chǎn)物進行毛細管電泳,嚴格按照片段長度進行分離。

   熒光檢測:PCR引物或探針上標記有熒光基團,因此每個長度的片段會產(chǎn)生一個熒光信號峰。

 5步:數(shù)據(jù)分析

   峰高/面積 = 相對拷貝數(shù):通過軟件分析每個峰的高度或面積。將其與同一反應中多個內(nèi)參基因(已知為二倍體,拷貝數(shù)穩(wěn)定)的峰進行比較。

   結果解讀:

       正??截悢?shù)(2份):靶位點峰高與內(nèi)參峰高比值約為1.0。

       缺失(1份或0份):比值約為0.50。

       重復/擴增(3份或以上):比值約為1.5或更高。

三、 MLPA原理的獨特優(yōu)勢

1.  高通量:單次反應可輕松檢測40-50個不同的靶位點。

2.  高特異性與準確性:依賴雙探針wanmei結合"的連接步驟,如同雙重校驗,極大減少了非特異性擴增。

3.  DNA質(zhì)量要求低:因為探針很短(~50-70 nt),即使DNA部分降解(如FFPE樣本),也能有效雜交和連接,而長片段PCR則會失敗。

4.  可檢測甲基化(MS-MLPA):通過對右探針的雜交序列進行HhaI酶切位點設計。如果靶序列被甲基化,酶切被阻止,探針可連接擴增;如果未甲基化,酶切斷開探針,無法擴增。通過比較酶切處理與未處理的信號,即可判斷甲基化狀態(tài)。

四、與其他技術的核心區(qū)別

特性

MLPA

定量PCR

微陣列比較基因組雜交

原理基礎

連接依賴的探針擴增

引物延伸擴增

芯片上的競爭性雜交

通量

中等(多重)

低(通常單重或少量多重)

高(全基因組)

檢測目標

已知靶點的CNV/甲基化

已知單靶點CNV/表達

未知/全基因組CNV

DNA需求/質(zhì)量

低,耐受降解

很低

高,需要高質(zhì)量DNA

 

總結來說,MLPA的原理精髓在于其連接依賴"長度編碼"的設計,使其成為檢測已知基因拷貝數(shù)變異和甲基化的一種高度多重、精準且經(jīng)濟高效的技術,特別適用于臨床診斷和大規(guī)模篩查。


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荷蘭MRC部分產(chǎn)品目錄:

產(chǎn)品品類

產(chǎn)品名稱

貨號

MLPA探針

SALSA MLPA探針P333 EP300

P333

SALSA MLPA探針P334 Gonadal

P334

SALSA MLPA探針P335 ALL-IKZF1

P335

SALSA MLPA探針P343 Autism-1

P343

MLPA試劑

SALSA MLPA試劑盒- 100 reactions (6 vials) - Cy5

EK1-CY5

SALSA MLPA試劑盒 - 100 reactions (6 vials) - FAM

EK1-FAM

SALSA MLPA試劑盒 - 500 reactions - Cy5

EK5-CY5

SALSA MLPA試劑盒 - 500 reactions - FAM

EK5-FAM

SALSA MLPA試劑盒 - 2000 reactions - FAM

EK20-FAM

DigitalMLPA探針

SALSA digitalMLPA Probemix D001 Hereditary Cancer Panel 1

D001

SALSA digitalMLPA Probemix D006 Multiple Myeloma

D006

SALSA digitalMLPA Probemix D007 Acute Lymphoblastic Leukemia

D007

DigitalMLPA試劑

SALSA digitalMLPA Reagent Kit

DRK01

SALSA digitalMLPA Barcode Plate

BP01

SALSA Ligase Buffer A - 360 µl

SMR12

SALSA Ligase-65 - 115 µl

SMR20

SALSA PCR Primer Mix P5P7 - 240 µl

SMR25

SALSA MLPA Buffer - 180 µl

SMR33

SALSA Ligase Buffer C - 360 µl

SMR37

SALSA Polymerase - 115 µl

SMR55

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